На иностранца начисляются налоги с ФОТ, это неправильно.

В справочнике сотрудники открыть данного сотрудника, вкладка Общие, реквизит Гражданство. Поставить галочку «Не имеет права на обязательное страхование» с учетом того, что реквизит периодический (Надо выбрать дату с какого числа действует настройка.)